| 樹木名 | 科名 | 分類 | 六甲山系での分布密度 ◎：非常に多い ○：多い △：所々 ▲：稀 |
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| マキエハギ | マメ科 | 落葉小低木 | ▲ | |
| ★ | マグワ | クワ科 | 落葉小高木 | ▲ |
| マサキ | ニシシギ科 | 常緑低木 | △ | |
| マタタビ | マタタビ科 | 落葉つる性木本 | △ | |
| マツブサ | マツブサ科 | 落葉つる性木本 | △ | |
| マツグミ | ヤドリギ科 | 常緑小低木 | △ | |
| ★ | マテバシイ | ブナ科 | 常緑高木 | ○ |
| マルバアオダモ | モクセイ科 | 落葉高木 | ○ | |
| マルバウツギ | ウツギ科 | 落葉低木 | △ | |
| マルバヤナギ | ヤナギ科 | 落葉高木 | △ | |
| マユミ | ニシキギ科 | 落葉低木 | △ | |
| マルバハギ | マメ科 | 落葉低木 | ○ | |
| マンサク | マンサク科 | 落葉小高木 | △ | |
| マンリョウ | ヤブコウジ科 | 常緑小高木 | △ | |
| ミカエリソウ | シソ科 | 落葉低木 | △ | |
| ミズキ | ミズキ科 | 落葉高木 | △ | |
| ミズナラ | ブナ科 | 落葉高木 | △ | |
| ミズメ | ハンノキ科 | 落葉高木 | ▲ | |
| ミツバウツギ | ミツバウツギ科 | 落葉低木 | ▲ | |
| ★ | ミヤギノハギ | マメ科 | 落葉低木 | △ |
| ミヤコイバラ | バラ科 | 落葉低木 | △ | |
| ミヤコツツジ | ツツジ科 | 落葉低木 | △ | |
| ミヤマウグイスカグラ | スイカズラ科 | 落葉低木 | △ | |
| ミヤマガマズミ | スイカズラ科 | 落葉低木 | ○ | |
| ミヤマシキミ | ミカン科 | 常緑低木 | △ | |
| ミヤマハハソ | アワブキ科 | 落葉低木 | △ | |
| ムクノキ | ニレ科 | 落葉高木 | △ | |
| ムベ | アケビ科 | 常緑つる性木本 | ○ | |
| ムラサキシキブ | クマツヅラ科 | 落葉低木 | ○ | |
| メギ | メギ科 | 落葉低木 | △ | |
| モチツツジ | ツツジ科 | 半落葉低木 | ○ | |
| モチノキ | モチノキ科 | 常緑高木 | △ | |
| モッコク | ツバキ科 | 常緑高木 | △ | |
| モミ | モミ科 | 常緑針葉高木 | ○ | |
| ★ | ヤエクチナシ | アカネ科 | 常緑低木 | △ |
| ヤツデ | ウコギ科 | 常緑低木 | ○ | |
| ヤドリギ | ヤドリギ科 | 常緑低木 | ▲ | |
| ヤブウツギ | スイカズラ科 | 落葉低木 | △ | |
| ヤブコウジ | ヤブコウジ科 | 常緑低木 | △ | |
| ヤブサンザシ | ユキノシタ科 | 落葉低木 | ▲ | |
| ヤブツバキ | ツバキ科 | 常緑高木 | ○ | |
| ヤブデマリ | スイカズラ科 | 落葉小高木 | ▲ | |
| ヤブニッケイ | クスノキ科 | 常緑高木 | ○ | |
| ヤブムラサキ | クマツヅラ科 | 落葉低木 | ○ | |
| ヤマアジサイ | ユキノシタ科 | 落葉低木 | ○ | |
| ヤマイバラ | バラ科 | 落葉低木 | ▲ | |
| ヤマウグイスカグラ | スイカズラ科 | 落葉低木 | ○ | |
| ヤマウコギ | ウコギ科 | 落葉低木 | ▲ | |
| ヤマウルシ | ウルシ科 | 落葉小高木 | △ | |
| ヤマガキ | カキ科 | 落葉高木 | △ | |
| ヤマグルマ | ヤマグルマ科 | 常緑高木 | ▲ | |
| ヤマコウバシ | クスノキ科 | 落葉小高木 | ○ | |
| ヤマザクラ | バラ科 | 落葉高木 | ○ | |
| ヤマシグレ | スイカズラ科 | 落葉低木 | ▲ | |
| ヤマツツジ | ツツジ科 | 落葉低木 | ○ | |
| ヤマナシ | バラ科 | 落葉高木 | △ | |
| ヤマナラシ | ヤナギ科 | 落葉高木 | △ | |
| ヤマハギ | マメ科 | 落葉低木 | ○ | |
| ヤマハゼ | ウルシ科 | 落葉小高木 | △ | |
| ヤマブキ | バラ科 | 落葉低木 | △ | |
| ヤマフジ | マメ科 | 落葉つる性木本 | ▲ | |
| ヤマボウシ | ミズキ科 | 落葉高木 | △ | |
| ヤマモモ | ヤマモモ科 | 常緑高木 | ○ | |
| ヤマヤナギ | ヤナギ科 | 落葉高木 | △ | |
| ユキグニミツバツツジ | ツツジ科 | 落葉低木 | ▲ | |
| ヨコグラノキ | クロウメモドキ科 | 落葉小高木 | ▲ | |
| リョウブ | リョウブ科 | 落葉小高木 | ○ | |
| リンボク | バラ科 | 常緑高木 | ▲ | |
| ワタゲカマツカ | バラ科 | 落葉小高木 | ▲ | |
| 六甲山系の樹木図鑑（樹種名ア行〜カ行） | 六甲山系の樹木図鑑（樹種名サ行〜ハ行） | |||
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