| 草本名 | 科名 | 花の色 | 六甲山系での分布密度 ◎：非常に多い ○：多い △：所々 ▲：稀 ×：自生せず |
| マツカゼソウ | ミカン科 | ▲ | |
| マツバウンラン | ゴマノハグサ科 | △ | |
| マツムシソウ | マツムシソウ科 | ▲ | |
| ママコナ | ゴマノハグサ科 | △ | |
| ママコノシリヌグイ | タデ科 | △ | |
| マメヅタラン | ラン科 | ▲ | |
| マルバマンネングサ | ベンケイソウ科 | △ | |
| マルバルコウ | ヒルガオ科 | △ | |
| マルミノヤマゴボウ | ヤマゴボウ科 | ▲ | |
| ミズオオバコ | トチカガミ科 | △ | |
| ミズキボウシ | ユリ科 | △ | |
| ミズタマソウ | アカバナ科 | △ | |
| ミズトンボ | ラン科 | ▲ | |
| ミズヒキ | タデ科 | ○ | |
| ミゾカクシ | キキョウ科 | △ | |
| ミゾソバ | タデ科 | ○ | |
| ミソハギ | ミソハギ科 | △ | |
| ミゾホオズキ | ゴマノハグサ科 | △ | |
| ミチタネツケバナ | アブラナ科 | ○ | |
| ミツガシワ | ミツガシワ科 | × | |
| ミツバツチグリ | バラ科 | △ | |
| ミツバベンケイソウ | ベンケイソウ科 | △ | |
| ミミカキグサ | タヌキモ科 | △ | |
| ミミナグサ | ナデシコ科 | ○ | |
| ミヤコオトギリ | オトギリソウ科 | △ | |
| ミヤコグサ | マメ科 | △ | |
| ミヤコザサ | イネ科 | ○ | |
| ミヤマウズラ | ラン科 | △ | |
| ミヤマカタバミ | カタバミ科 | △ | |
| ミヤマキケマン | ケシ科 | △ | |
| ミヤマナルコユリ | ユリ科 | △ | |
| ミヤマハコベ | ナデシコ科 | △ | |
| ミヤマヨメナ | キク科 | △ | |
| ムカゴニンジン | セリ科 | ▲ | |
| ムシトリナデシコ | ナデシコ科 | △ | |
| ムラサキカタバミ | カタバミ科 | ○ | |
| ムラサキケマン | ケシ科 | △ | |
| ムラサキサギゴケ | ゴマノハグサ科 | ○ | |
| ムラサキセンブリ | リンドウ科 | ▲ | |
| ムラサキニガナ | キク科 | △ | |
| ムラサキバレンギク | キク科 | ▲ | |
| ムラサキミミカキグサ | タヌキモ科 | ▲ | |
| ムロウテンナンショウ | サトイモ科 | △ | |
| ムロウマムシグサ | サトイモ科 | ▲ | |
| メキシコマンネングサ | ベンケイソウ科 | △ | |
| メドハギ | マメ科 | ○ | |
| メナモミ | キク科 | △ | |
| メハジキ | シソ科 | △ | |
| メリケンムグラ | アカネ科 | ○ | |
| モウセンゴケ | モウセンゴケ科 | ▲ | |
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